Mycorhize

Mycorhizes

La mycorhization est le résultat de l'association symbiotique entre des champignons du sol et les racines des plantes. Elle est rendue possible lorsque l’hyphe (appareil végétatif du champignon d’aspect filamenteux) ^[1] d’un champignon mycorhizien se connecte aux cellules du système racinaire d’une plante.

On estime environ à 95 % les espèces végétales qui peuvent réaliser la mycorhization avec des champignons du sol. Cette symbiose entre les deux règnes comporte de nombreux bénéfices pour la croissance et le bon développement des plantes même sur une parcelle de cultures.

Plusieurs facteurs doivent être respectés si on veut éviter la destruction du mycélium (tissu cellulaire composé des hyphes d’un ou plusieurs champignons et formant un réseau de circulation des nutriments dans le sol)^[2] des champignons bénéfiques et ainsi favoriser la mycorhization des bons champignons avec les plantes cultivées.

Principe

Les Champignons Mycorhiziens Arbusculaires (CMA) sont à l’origine d’environ 80% des mycorhizes des espèces végétales dont les plantes agricoles et horticoles. Le potentiel de mycorhization d’une plante varie d’une espèce à l’autre : les graminées (maïs, sorgho, millet, etc.), les fabacées (pois, haricots, crotalaire, etc.) et les alliacées (poireau, oignon, etc.) sont les familles végétales qui mycorhizent le plus, on les appelle les espèces mycorhizotrophes. À ce jour, il n'est pas prouvé que les brassicacées (chou, radis, navet, roquette, etc.) et les chénopodiacées (amarante, betterave) fassent de mycorhization avec CMA.^[3]^[4]^[5]

La plante peut fournir jusqu'à 30 % de ces composés carbonés (glucose, fructose) issus de la photosynthèse quand le champignon lui fournit de l'eau et des minéraux indispensables (N, P, K) et des oligo-éléments (Cu, Zn, Mn).

Les champignons mycorhiziens constituent un conduit majeur des sucres dans le sol. Leurs hyphes colonisent la rhizosphère et permettent une meilleure répartition des composants organiques (enzymes, exsudats racinaires etc) dans les interstices du sol que les bactéries qui sont plutôt statiques.
Les hyphes mycorhiziens sécrètent des quantités importantes d'exsudats de la rhizosphère.
Les mycorhizes forment également des symbioses avec les bactéries pour l'azote, le phosphore et le soufre. Ils sécrètent des exsudats venant de la plante pour stimuler ces bactéries autour des hyphes, ce qui améliore la formation de l'humus.
Elle augmente la stabilité des agrégats qui aide à protéger des molécules de la dégradation. Les hyphes "collent" les particules minérales du sol (argiles, limons, sables) et intègrent les composants organiques dans les agrégats pour les stabiliser et les protéger de la dégradation.

La mycorhize d'une plante à fleur^[6]

Pourquoi protéger et favoriser la mycorhization ?

Les bénéfices de la mycorhization pour les cultures et l’agrosystème sont multiples :

Biodisponibilité du phosphore du sol : Les champignons mycorhiziens, grâce à des enzymes et des associations avec des bactéries spécifiques, sont les seuls à fournir les plantes en phosphore dans la nature. Cet élément clef de la constitution et du fonctionnement des êtres vivants (membranes, acides nucléiques, métabolisme de base) est indispensable à la vie cellulaire, à la bonne santé des végétaux, des animaux et des êtres humains. De plus, il est très peu mobile dans les sols et sans mycorhize, les plantes épuisent très rapidement leurs sites d’approvisionnement (se situant entre 1 et 2 mm autour des poils absorbants) et deviennent dépendantes des engrais phosphatés.

Absorption des oligo-éléments : Elle est facilitée, ce qui représente un plus pour les défenses immunitaires de la plante.

Fixation de l’azote organique par le rhizobium : Les légumineuses sont particulièrement dépendantes des champignons car elles ont besoin de beaucoup de phosphore pour que les bactéries de leurs nodosités fixent l’azote. Sans les mycorhizes, la fixation de l’azote par les légumineuses serait très limitée.

Lutte contre le stress hydrique : Les champignons sont de précieux alliés pour l’adaptation à la sécheresse et au dérèglement climatique. En effet, le mycélium a une capacité d’exploration du sol mille fois plus importante que les racines d’une plante (pour 1 cm de racine dans le sol, il y a 10 m de mycélium), les champignons sont donc capables d’absorber de l’eau plus loin en profondeur et horizontalement dans le sol. De plus, l’hyphe d’un champignon a un diamètre plus petit que celui d’une racine (1/100 de mm contre 1/10 à 1 mm) leur permettant de pénétrer dans la microporosité du sol et d’y trouver l’eau qui y persiste lors de périodes sèches. Les champignons mycorhiziens favorisent également la régulation de la synthèse de l’acide abscissique (ABA), une hormone végétale à l’origine de la fermeture des stomates le jour et donc de l’évapotranspiration.

Lutte contre le stress à la salinité : Une étude a démontré que les plantes qui avaient effectué une mycorhize étaient moins sensibles à la salinité du milieu comparé aux plantes témoins. Les champignons mycorhiziens utilisés pourraient ajuster la physiologie des plantes et par conséquent améliorer leur croissance et leur productivité.^[7]

Lutte biologique contre les pathogènes : Les CMA jouent un rôle majeur dans l’immunité des plantes face aux bactéries pathogènes du sol et aux nématodes. Plusieurs cas de figure ont été observés :
- La compétition directe : En recouvrant les tissus racinaires, le mycélium des CMA empêche des espèces fongiques pathogènes de prendre leur place et de parasiter la plante. Cependant son potentiel de compétition est plutôt faible, c’est pourquoi les CMA doivent être en symbiose avec la plante six mois avant l’attaque des pathogènes.
- Favorisation des bactéries concurrentes des pathogènes : Les CMA activent, chez la plante, la synthèse de phytohormones à l’origine de l’augmentation des sécrétions racinaires de la plante, servant ainsi de nourriture aux populations bactériennes concurrentes des bactéries pathogènes.
- Apport de molécules de défense : Les CMA synthétisent des molécules toxiques contre les agresseurs (polyphénols, alcaloïdes), des enzymes de défense (protéases, chitinases), ou encore des composants pour renforcer la paroi des cellules racinaires (callose).

Maintien de la structure du sol : Les champignons contribuent au maintien de la structure des parties minérales et organiques du sol grâce au mycélium et à la sécrétion de la glomaline, une glycoprotéine qui a un effet "glue" sur les composants des agrégats.

Santé humaine : Des observations ont montré que les associations avec des CMA entraînent une fructification précoce des arbres fruitiers (pommier) et une amélioration de la qualité des produits maraîchers (fraise, artichaut, melon, tomate, etc.) de par leur concentration supérieure en antioxydants et en sucres.

Comment favoriser la mycorhization dans la parcelle ?

Le mycélium est un tissu cellulaire fragile qui s’étend majoritairement 10 cm sous la surface, l’agriculteur soucieux de préserver les mycorhizes devra s'astreindre à des pratiques qui impactent le moins possible l’état physique et biologique du sol et privilégier les passages superficiels.

Privilégier une fertilisation organique plutôt que minérale permet de stimuler le développement des bactéries associées aux champignons et donc de favoriser le développement de ces derniers. A l’inverse, apporter des amendements minéraux directement absorbable par les plantes limitera l’apparition de mycorhizes. L’apport d’engrais phosphaté est à proscrire car ils bloquent complètement la mycorhization, freinent l’expansion des CMA dans le sol et coupent les plantes des avantages essentiels dont elles bénéficieraient avec les mycorhizes.

Le meilleur moyen de préserver les mycorhizes des sols est idéalement de laisser une couverture maximale du sol grâce aux couverts végétaux. Plus la diversité d’espèces végétales sera grande sur la parcelle (cultures agricoles comme adventices), plus la mycorhization sera importante. Il est possible également de laisser ses parcelles peu productives en jachère, à partir du moment où on laisse le système racinaire sur place lors de la fauche ou de la destruction de la parcelle.

Enfin, une des clés pour favoriser au mieux les mycorhizes dans les champs est d’introduire des espèces mychorhizotrophes dans la rotation et la diversifier le plus possible. Les légumineuses sont des particulièrement adaptée à cette tâche en plus de fournir un apport d’azote à la culture suivante.

Pratiques favorables	Pratiques défavorables
Travail du sol peu profond. Couverture maximale / couverts végétaux. Jachère sans arrachage en fin de cycle. Rotation plus longue. Introduction d’espèces mycorhizotrophes (Graminées, Légumineuses ou Alliacées). Apport d’engrais organiques (compost, fumier, BRF…). Peu ou pas de fongicides et d’herbicides.	Travail du sol profond / Labour. Sol nu ou arrachage des jachères. Apport de phosphate et autres engrais minéraux. Monoculture. Introduction d’espèces non mycorhiziennes (Brassicacées ou Chénopodiacées). Forte utilisation de fongicides et d’herbicides.

Multiplier et inoculer des champignons mycorhiziens

Article détaillé : Multiplier et inoculer des champignons mycorhiziens indigènes

Si un sol a subi un travail profond ou des traitements fongiques réguliers, il peut être intéressant d'inoculer une nouvelle population de CMA pour repartir sur de bonnes bases. Il sera impératif d'éviter le plus possible les pratiques qui défavorisent la présence des champignons mycorhiziens (voir tableau ci-dessus) afin que la nouvelle population ait une chance de s'installer dans la parcelle et de réaliser la mycorhization avec les plantes.

Ensuite, il est nécessaire de choisir la population de CMA à inoculer et la multiplier. Une multitude de souches existent et peuvent faire l'objet d'une multiplication, industrielle ou artisanale. On distingue 3 origines de souches de champignons mycorhiziens, dont les possibilités de multiplication sont variées :

Standardisées : Elles peuvent être produites industriellement in vivo (en plein sol, sur substrat inerte, en hydroponie ou en aéroponie) ou in vitro (sur racines transformées). Elles ont un large spectre de colonisation, un fort taux de multiplication et sont commercialisées en association à des biofertilisants liquides (fertirrigation), des substrats tels que le terreau, de l'argile pour l'enrobage de graines et à mélanger au substrat de semis (voir résultats d'expérimentation sur cultures légumières par CA 56).
Locales sélectionnées (répertoriées) : Dédiées à leur territoire d’origine, elles peuvent être multipliées au sein d’unités de production régionales, sur différents types de sols pour être adaptées à des conditions pédoclimatiques spécifiques.
Indigènes (non-répertoriées) : Dédiées à une petite région agricole, elles sont multipliées de façon artisanale par des unités de production régionales ou directement sur l’exploitation agricole. Cette production a lieu en plein sol ou sur substrat (gravier, pierre ponce, perlite).