Carbone microbien du sol
Le carbone microbien est le carbone contenu dans les microorganismes vivants du sol. On parle également de “biomasse microbienne” ou de “Matière Organique Vivante” (MOV). C’est un indicateur de l’abondance de microorganismes (bactéries et champignons) dans le sol.
Les résultats sont exprimés d’une part en valeurs absolues (MOV en mg de carbone organique/kg de terre sèche), d’autre part en pourcentage du carbone organique total du sol (MOV en % de Corg).
Norme
La méthode de mesure est la méthode de fumigation-extraction au chloroforme (Jenkinson & Powlson, 1976 ; Chaussod et al., 1988 ; Wu et al. 1990).
NF EN ISO 14240-2 : Qualité du sol - Détermination de la biomasse microbienne du sol - Partie 2 : méthode par fumigation-extraction.
Échantillonnage et logistique
Analyse sur sol frais.
Description de la méthode de mesure
La méthode consiste à doser le carbone provenant de la lyse cellulaire des microorganismes par fumigation au chloroforme.
Le résultat correspond à la différence de teneur en carbone entre un échantillon fumigé et non fumigé. Cette différence de carbone est directement proportionnelle à la quantité de microorganismes tués par le chloroforme.
Exemple de gammes de variation
| Situation | Min | Max | Médiane |
| Sol viticole / IFV-Sicarex Beaujolais, 2021
Nb obs = 61 Profondeur : 0-20 cm |
24 mg C/kg de terre | 540 mg C/kg de terre | 81 mg C/kg de terre |
| 0,4 % du C total | 7,2 % du C total | 1,4 % du C total | |
| Sol grandes cultures et polyculture-élevage / France
Nb obs : 183 Profondeur : 0-20 cm |
114 mg C/kg de terre | 690 mg C/kg de terre | 309 mg C/kg de terre |
| 0,9 % du C total | 4,8 % du C total | 2,3 % du C total |
Interprétation
Plus la teneur en carbone microbien est élevée, plus la quantité de microorganismes est importante. Cet indicateur est à interpréter en fonction du type de sol (par exemple texture) car ce dernier influe fortement sur le niveau mesuré. Il existe une corrélation positive entre biomasse microbienne et minéralisation de la MO (plus il y a de microorganismes, plus la MO est minéralisée).
Un lien positif avec la stabilité structurale a déjà été observé. La biomasse microbienne est un indicateur sensible et précoce d’une modification du statut organique du sol, ainsi, si le sol est perturbé, la biomasse microbienne augmente ou diminue rapidement. Les valeurs exprimées en % du Corg (soit Cmicrobien/Corg x 100) permettent d’approcher l’évolution des quantités de microorganismes indépendamment de l’évolution des teneurs en carbone. Si le rapport Cmicrobien/Corg augmente, la proportion de MOV augmente et inversement si le rapport diminue, la proportion de MOV diminue aussi.
Avantages et limites
Avantages
- Indicateur de quantité de microorganismes assez mature
- Utilisable en situation de conseil
Limites
- A réaliser sur un échantillon de sol frais
- Cet indicateur est à interpréter en fonction de certains paramètres physico-chimique du sol, notamment texture, pH et teneur en carbone organique
- Prix : 60-80€
Source
- RMT Bouclage. 2025. Indicateurs de fonctionnement biologique des sols agricoles. [03/11/25]. https://www.rmt-fertilisationetenvironnement.org/moodle/pluginfile.php/5041/mod_resource/content/3/Recueil%20indicateurs%20de%20fonctionnement%20biologique%20des%20sols%20agricoles_vf251009.pdf
- Chaussod R, Houot S. 1993. La biomasse microbienne des sols : perspectives d’utilisation de cette mesure pour l’estimation de la fourniture d’azote par les sols. 5e Forum de la Fertilisation Raisonnée, Blois, 16-18 novembre 1993, pp. 17-26.
- Chaussod R, Houot S, Guiraud G, et al. 1988. Size and turnover of the microbial biomass in agricultural soils: laboratory and field measurements. Deschamps T, et al. (2022). Guide d’interprétation à l’analyse des bioindicateurs. https://www.arvalis.fr/infos-techniques/%20douze-indicateurs-pour-evaluer-la-fertilite-biologique-du-sol
- Jenkinson D S, Powlson D S. 1976. The effects of biocidal treatments on metabolism in soil—V: A method for measuring soil biomass. Soil Biology and Biochemistry, vol. 8, no 3, p. 209-213.
- Wu J, Pommerening B, Chaussod R, et al. 1990. Measurement of soil microbial biomass C by fumigation-extraction – an automated procedure. Soil Biology and Biochemistry, vol. 22, no 8, p. 1167-1169..
